Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOCADQ5VW36 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
FOCADQ5VW36 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOCADQ5VW36 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOCADQ5VW36 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms