Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GFI1BQ5VTD9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GFI1BQ5VTD9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GFI1BQ5VTD9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms