Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC38Q5VT99 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC38Q5VT99 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC38Q5VT99 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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