Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN9Q5TKA1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIN9Q5TKA1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LIN9Q5TKA1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIN9Q5TKA1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms