Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRTP1Q5TC63 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRTP1Q5TC63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRTP1Q5TC63 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRTP1Q5TC63 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms