Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEPDC1Q5TB30 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DEPDC1Q5TB30 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DEPDC1Q5TB30 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms