Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM78Q5T7P6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM78Q5T7P6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms