Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2LQ5T4T6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYCP2LQ5T4T6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYCP2LQ5T4T6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms