Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZK1Q5T2W1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZK1Q5T2W1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms