Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARS2Q5T160 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARS2Q5T160 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARS2Q5T160 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms