Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C6orf141Q5SZD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C6orf141Q5SZD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C6orf141Q5SZD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms