Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF678Q5SXM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF678Q5SXM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF678Q5SXM1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms