Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SAMD9Q5K651 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SAMD9Q5K651 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SAMD9Q5K651 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SAMD9Q5K651 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SAMD9Q5K651 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.21■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
SAMD9Q5K651 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SAMD9Q5K651 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms