Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CT47A1Q5JQC4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CT47A1Q5JQC4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CT47A1Q5JQC4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms