Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HERC4Q5GLZ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HERC4Q5GLZ8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HERC4Q5GLZ8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERC4Q5GLZ8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms