Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF628Q5EBL2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF628Q5EBL2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF628Q5EBL2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF628Q5EBL2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF628Q5EBL2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF628Q5EBL2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF628Q5EBL2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF628Q5EBL2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF628Q5EBL2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF628Q5EBL2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms