Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALFQ53S48 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALFQ53S48 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALFQ53S48 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALFQ53S48 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms