Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC92Q53HC0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC92Q53HC0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC92Q53HC0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms