Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GNPTABQ3T906 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GNPTABQ3T906 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GNPTABQ3T906 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms