Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTLL9Q3SXZ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL9Q3SXZ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL9Q3SXZ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL9Q3SXZ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms