Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCB5Q2M3G0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABCB5Q2M3G0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCB5Q2M3G0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCB5Q2M3G0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms