Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT3

CLEC16A, Protein CLEC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC16AQ2KHT3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLEC16AQ2KHT3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLEC16AQ2KHT3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLEC16AQ2KHT3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms