Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MICBQ29980 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MICBQ29980 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MICBQ29980 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MICBQ29980 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MICBQ29980 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MICBQ29980 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MICBQ29980 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MICBQ29980 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MICBQ29980 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MICBQ29980 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MICBQ29980 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MICBQ29980 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MICBQ29980 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MICBQ29980 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MICBQ29980 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MICBQ29980 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MICBQ29980 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MICBQ29980 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MICBQ29980 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MICBQ29980 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MICBQ29980 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MICBQ29980 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MICBQ29980 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MICBQ29980 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MICBQ29980 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MICBQ29980 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MICBQ29980 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MICBQ29980 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MICBQ29980 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MICBQ29980 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MICBQ29980 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MICBQ29980 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MICBQ29980 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MICBQ29980 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MICBQ29980 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MICBQ29980 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MICBQ29980 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MICBQ29980 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MICBQ29980 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MICBQ29980 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MICBQ29980 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MICBQ29980 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MICBQ29980 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MICBQ29980 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MICBQ29980 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MICBQ29980 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MICBQ29980 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MICBQ29980 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MICBQ29980 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MICBQ29980 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MICBQ29980 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MICBQ29980 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MICBQ29980 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MICBQ29980 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MICBQ29980 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MICBQ29980 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MICBQ29980 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MICBQ29980 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MICBQ29980 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MICBQ29980 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MICBQ29980 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MICBQ29980 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MICBQ29980 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICBQ29980 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICBQ29980 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICBQ29980 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICBQ29980 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICBQ29980 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MICBQ29980 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms