Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q1T7F1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q1T7F1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q1T7F1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q1T7F1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q1T7F1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q1T7F1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q1T7F1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q1T7F1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q1T7F1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q1T7F1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q1T7F1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q1T7F1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q1T7F1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q1T7F1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q1T7F1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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