Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LONRF1Q17RB8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF1Q17RB8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF1Q17RB8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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