Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LAMA3Q16787 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMA3Q16787 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMA3Q16787 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMA3Q16787 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms