Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPPQ16740 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPPQ16740 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPPQ16740 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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