Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDK4Q16654 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK4Q16654 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK4Q16654 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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