Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMN1Q16637 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMN1Q16637 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMN1Q16637 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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