Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCAQ16586 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCAQ16586 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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SGCAQ16586 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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SGCAQ16586 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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