Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACKR1Q16570 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACKR1Q16570 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACKR1Q16570 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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