Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYPL1Q16563 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYPL1Q16563 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYPL1Q16563 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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