Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DDB1Q16531 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
DDB1Q16531 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
DDB1Q16531 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DDB1Q16531 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
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