Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PKN1Q16512 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PKN1Q16512 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKN1Q16512 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKN1Q16512 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKN1Q16512 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PKN1Q16512 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PKN1Q16512 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PKN1Q16512 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PKN1Q16512 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PKN1Q16512 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKN1Q16512 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PKN1Q16512 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PKN1Q16512 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKN1Q16512 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PKN1Q16512 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PKN1Q16512 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PKN1Q16512 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PKN1Q16512 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PKN1Q16512 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PKN1Q16512 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKN1Q16512 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PKN1Q16512 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PKN1Q16512 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKN1Q16512 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PKN1Q16512 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PKN1Q16512 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKN1Q16512 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PKN1Q16512 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKN1Q16512 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
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