Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGIF1Q15583 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGIF1Q15583 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TGIF1Q15583 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.4 ms