Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDSNQ15517 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDSNQ15517 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDSNQ15517 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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