Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNN3Q15417 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CNN3Q15417 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
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