Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDK3Q15120 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDK3Q15120 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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