Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPNMBQ14956 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GPNMBQ14956 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPNMBQ14956 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPNMBQ14956 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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