Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSPNQ14714 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SSPNQ14714 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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