Protein–RNA interactions for Protein: Q14525

KRT33B, Keratin, type I cuticular Ha3-II, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33BQ14525 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT33BQ14525 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT33BQ14525 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT33BQ14525 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms