Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKP1Q13835 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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PKP1Q13835 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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PKP1Q13835 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKP1Q13835 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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PKP1Q13835 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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PKP1Q13835 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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PKP1Q13835 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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PKP1Q13835 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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PKP1Q13835 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
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PKP1Q13835 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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PKP1Q13835 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PKP1Q13835 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKP1Q13835 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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