Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PICALMQ13492 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PICALMQ13492 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PICALMQ13492 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PICALMQ13492 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PICALMQ13492 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PICALMQ13492 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PICALMQ13492 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms