Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5R2Q13319 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK5R2Q13319 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK5R2Q13319 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms