Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PRDM2Q13029 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PRDM2Q13029 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PRDM2Q13029 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC41.44■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
PRDM2Q13029 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PRDM2Q13029 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
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