Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXF1Q12946 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXF1Q12946 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXF1Q12946 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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