Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMAN2Q12907 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LMAN2Q12907 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMAN2Q12907 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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