Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SFSWAPQ12872 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFSWAPQ12872 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SFSWAPQ12872 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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