Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-8■■□□□ 14
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GRSF1Q12849 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.691e-8■■□□□ 14
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GRSF1Q12849 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.261e-6■■□□□ 13.9
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GRSF1Q12849 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.221e-6■■□□□ 13.9
GRSF1Q12849 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 13.9
GRSF1Q12849 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-13■■□□□ 13.9
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GRSF1Q12849 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-6■■□□□ 13.9
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GRSF1Q12849 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.438e-8■■□□□ 13.9
GRSF1Q12849 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.498e-8■■□□□ 13.9
GRSF1Q12849 NOC2L-205ENST00000487214 865 ntTSL 320.31■□□□□ 0.849e-7■■□□□ 13.9
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GRSF1Q12849 PLXND1-202ENST00000501038 1633 ntTSL 1 (best)17.97■□□□□ 0.479e-7■■□□□ 13.9
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GRSF1Q12849 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.29e-7■■□□□ 13.9
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GRSF1Q12849 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.629e-7■■□□□ 13.9
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GRSF1Q12849 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-7■■□□□ 13.8
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GRSF1Q12849 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.666e-7■■□□□ 13.8
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GRSF1Q12849 IMPDH2-208ENST00000481274 840 ntTSL 216.75■□□□□ 0.272e-8■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 STX10-208ENST00000591197 907 ntTSL 323.63■■□□□ 1.373e-10■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.373e-10■■□□□ 13.7
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GRSF1Q12849 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.874e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.834e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.814e-7■■□□□ 13.7
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GRSF1Q12849 STX10-210ENST00000591843 1073 ntTSL 518.88■□□□□ 0.613e-10■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.554e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.473e-10■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.454e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-10■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.394e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.393e-10■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 YIPF3-206ENST00000460903 605 ntTSL 216.63■□□□□ 0.254e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 YIPF3-205ENST00000460547 1674 ntTSL 1 (best)16.43■□□□□ 0.224e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 YIPF3-214ENST00000510102 1639 ntTSL 516.27■□□□□ 0.194e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 TMEM129-203ENST00000460722 1100 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 YIPF3-212ENST00000503972 933 ntTSL 515.68■□□□□ 0.14e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.034e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.084e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 ADCY9-207ENST00000576936 697 ntTSL 513.9□□□□□ -0.184e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 YIPF3-203ENST00000416380 1005 ntTSL 513.1□□□□□ -0.314e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 KIAA0100-202ENST00000528896 7407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.84e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.034e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.094e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.818e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.358e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.578e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 ELOC-203ENST00000519082 634 ntTSL 214.61□□□□□ -0.078e-7■■□□□ 13.7
GRSF1Q12849 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.828e-7■■□□□ 13.7
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