Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB40BQ12829 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB40BQ12829 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB40BQ12829 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB40BQ12829 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB40BQ12829 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB40BQ12829 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB40BQ12829 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB40BQ12829 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB40BQ12829 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB40BQ12829 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB40BQ12829 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB40BQ12829 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB40BQ12829 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB40BQ12829 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB40BQ12829 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB40BQ12829 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB40BQ12829 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB40BQ12829 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB40BQ12829 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB40BQ12829 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB40BQ12829 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB40BQ12829 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB40BQ12829 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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RAB40BQ12829 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB40BQ12829 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB40BQ12829 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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